一、系统故障和技术障碍
自助值机虽然提升了旅客的效率，但其依赖的技术平台也可能出现障碍。如果遇到系统崩溃、网络连接不稳定或自助机设备故障等情况，旅客自然无法完成值机。这种情况通常发生在高峰时段，主要是在航班增多或旅客集中出行的假期时，会导致系统负荷过大，有时甚至限于设备物理障碍，某些自助值机机型可能无法正常使用。在此之时，操作员有时也需要对设备进行维护和升级，这也可能加剧故障的频率。为避免这种情况，旅客在登机前最好提前确认航空公司是否有相关公告，并尽量提前到达机场，以便有足够时间进行人工值机。
二、护照或票务信息不匹配
旅客在进行自助值机时，系统会根据护照及订单信息进行核对。如果护照上的姓名拼写错误、护照已过期或者与购票信息不符，系统将无法完成值机。这种情况常见于姓名变更、护照更新未及时更新票务信息等情形。还可以，儿童或婴儿的票务信息也有可能在自助系统中出现障碍，因此有些航空公司对二胎政策的变化有不同的规定。为了避免这种情况，旅客在购票时应确保信息准确无误，并在航班出发前再次检查护照及票务信息的匹配。
三、需要特殊服务的旅客
一些旅客可能需要特别的服务，例如轮椅辅助、无障碍通道等。在自助值机的过程中，系统常常无法提供这些特殊服务的选项，导致无法完成值机。由此可见，对于需要特殊照顾的旅客，建议直接向航空公司咨询相关政策，并提前安排值机服务。还可以，部分航空公司为了确保旅客的安全与舒适，也会要求特殊服务旅客使用人工值机。为了确保顺利出行，这些旅客应提前预定相关服务并抵达机场，以便进行必要的检查及确认。
四、航班异常状态
航班的状态也会影响到自助值机的完成。假如航班延误、取消或更改，通常会导致自助值机无法进行。这是因此系统会依据航班状态进行信息更新，而在变化的情况下，原有的值机信息可能会失效。由此可见，旅客应当保持对航班状态的关注，尤其在气候变化或突发事件的情况下，及时了解航班信息并采取相应的措施。有时，航空公司会通过短信或邮件的方式通知旅客相关信息，在此情况下旅客若未能及时更新信息，很可能会面临未能完成自助值机的困境。
五、航空公司政策限制
不同的航空公司对于自助值机的规定各有不同。有些航空公司对特定的航班、代码共享航班或旅行套票设定了限制，规定这些旅客不能使用自助值机。除此之外，部分航空公司会在规定的航班类型或行李要求上对自助值机的旅客进行限制，这使得某些旅客只能通过人工柜台进行值机。由此可见，旅客在出行前务必了解自己所乘航空公司的相关政策，提前规划出行步骤，以便能顺利完成值机。